TL;DR: Refinar los modelos de distribución de especies de plantas amenazadas de México con información de sensores remotos y medidas espaciales de incertidumbre.
Abstract: El proyecto tiene como objetivo desarrollar y refinar los modelos de distribución (SDM) de 227 especies de plantas incluidas en la Norma Oficial Mexicana NOM-059-SEMARNAT-2010, pertenecientes a las familias Orchidaceae (188 especies), Pinaceae (30 especies), Cupressaceae (7 especies), Taxaceae (1 especie), and Podocarpaceae (1 especie), con la perspectiva de apoyar su manejo y conservación. El refinamiento de los SDM de estas especies amenazadas comprende dos grandes aspectos, (1) la inclusión de datos de percepción remota, además de los datos climáticos que se utilizan comúnmente, y (2) la evaluación espacial de la incertidumbre de los modelos. Para cada especie se generarán diferentes productos de las áreas de distribución (continuos, categóricos) a 1 km² de resolución utilizando diferentes algoritmos (e.g. Maxent, GLM, RandomForest). Las variables predictoras derivadas de datos de percepción remota que se utilizarán son series de tiempo del sensor Terra-MODIS (Indice de vegetación mejorado, EVI por sus siglas en inglés -Enhanced Vegetation Index-, temperatura de la superficie terrestre, LST -Land Surface Temperature- y la reflectancia de la superficie, las cuales han probado ser útiles para la clasificación de la vegetación. El proyecto también contempla evaluar la importancia del clima y de las variables de percepción remota en la distribución de las especies, así como la extracción de perfiles fenológicos para cada especie. Se producirán mapas de distribución generados con variables obtenidas mediante percepción remota ya que, sin bien como resultado de la modelación climática un sitio resulta ser adecuado para una especie, puede darse el caso de que la especie no esté presente. Estos mapas, en conjunto, permitirán identificar posibles 'hotspots' de deterioro de hábitat debido a causas antropogénicas a nivel país. El uso de datos de percepción remota actuales para la modelación de la distribución de especies allana el camino para la construcción de un sistema nacional de monitoreo de la biodiversidad. El proyecto está planteado como una colaboración entre el Helmholtz Centre for Environmental Research - UFZ y el Instituto de Biología de la Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM). Percepción remota, incertidumbre de los modelos , Máxima Entropía, GLM, RandomForest, modelo jerárquico, NOM-059-SEMARNAT-2010, plantas amenazadas , monitoreo de la biodiversidad Reino: 1 Filo: 1 Clase: 1 Orden: 4 Familia: 4 Género: 73 Subgénero: 2 Especie: 163 Epitetoinfraespecifico: 11
TL;DR: The chemosystematic results based on leaf oil analysis of northern North American conifers of the families Pinaceae and Cupressaceae are summarized and discussed in relation to known botanical relationships and other chemosSystematic approaches.
TL;DR: Phylogenetic analyses based on these four sequences gave consistent results and strongly supported the monophyly hypothesis for the genus Pinus and its two recognized subgenera.
Abstract: The sequence divergence of chloroplast rbcL, matK, trnV intron, and rpl20-rps18 spacer regions was analyzed among 32 Pinus species and representatives of six other genera in Pinaceae. The total aligned sequence length is 3570 bp. Of the four sequences examined, matK evolved much faster than rbcL in Pinus and in other Pinaceae genera. The two noncoding regions did not show more divergence than the two coding regions, especially within each Pinus subgenus. Phylogenetic analyses based on these four sequences gave consistent results and strongly supported the monophyly hypothesis for the genus Pinus and its two recognized subgenera. Pinus krempfii,the two-flat-needle pine endemic to Vietnam, was placed in subgen. Strobus and showed closer affinity to subsect. Gerardianae. The ancient character of sect. Parrya is further confirmed. However, monophyly of the sect. Parrya is not supported by our data. Among the Eurasian pines of subgen. Pinus, Mediterranean pines formed one clade and the Asian members of subsect. Sylvestres formed another. The Himalayan P. roxburghii showed considerable divergence from all the other hard pines from both regions. Pinus merkusii was distinctly separated from all the Asian members of subsect. Sylvestres. The implications of our results for Pinus classification are discussed.
TL;DR: The comparative mapping revealed extensive synteny and colinearity between genomes of the Pinaceae, consistent with the hypothesis of conservative chromosomal evolution in this important plant family.
Abstract: A comparative genetic map was constructed between two important genera of the family Pinaceae. Ten homologous linkage groups in loblolly pine (Pinus taeda L.) and Douglas fir (Pseudotsuga menziesii [Mirb.] Franco) were identified using orthologous expressed sequence tag polymorphism (ESTP) and restriction fragment length polymorphism (RFLP) markers. The comparative mapping revealed extensive synteny and colinearity between genomes of the Pinaceae, consistent with the hypothesis of conservative chromosomal evolution in this important plant family. This study reports the first comparative map in forest trees at the family taxonomic level and establishes a framework for comparative genomics in Pinaceae.